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医学实验班开设专业为临床医学，学制8年，完成学业后获临床医学博士学位（M.D.）。2009年招收首届学生，迄今已有12届学生。本专业培养目标为医师科学家，即科学探究能力与临床诊疗能力双优的临床医生，面对突发的临床问题，在诊疗中能够运用科学的思维发现疾病内因，用科学的头脑和方法解决攻克疑难杂症的创新型人才。医学实验班的优秀毕业生将会成为临床医学界的领军力量

基础医学博士研究生教育秉承清华大学价值塑造、能力培养、知识传授“三位一体”的教育理念，致力于培养具有良好的科学人文素养、宽厚扎实的生命科学与基础医学理论知识和实验技能、能够独立从事基础医学研究，且具有创新精神的专业人才。目前，我们拥有发育与再生、肿瘤、免疫、病原微生物与传染病、医学生物化学与遗传和神经生物学和神经退化性疾病等多个特色的学科方向。

本学科在生物医学工程的经典研究领域与新兴的研究方向齐头并进。学科形成了有特色的核心研究方向，包括：神经工程、医学影像、微纳医学与组织工程、医疗仪器。神经工程学是现代神经科学与电子、信息科学的交叉学科；致力于理解生物智能背后的神经机制，为下一代人工智能算法提供新思路，并为神经系统疾病诊断、治疗和康复提供新方法与新平台